Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms