Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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