Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BGNP21810 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BGNP21810 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BGNP21810 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BGNP21810 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BGNP21810 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BGNP21810 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BGNP21810 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BGNP21810 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms