Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBQ1P09105 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBQ1P09105 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms