Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA3O60609 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms