Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NDUFS4O43181 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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