Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms