Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCC2H7BZ55 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms