Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CCDC179H3BU77 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms