Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms