Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD3A2A2Y4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms