Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms