Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS3Q9UPU3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms