Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATXN7L1Q9ULK2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN7L1Q9ULK2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms