Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIDEBQ9UHD4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIDEBQ9UHD4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms