Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms