Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KLHL13Q9P2N7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KLHL13Q9P2N7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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