Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms