Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms