Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF275Q9NSD4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms