Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMPRSS4Q9NRS4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms