Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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