Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms