Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFGAP3Q9NP61 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms