Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms