Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms