Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HINFPQ9BQA5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms