Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms