Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms