Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD180Q99467 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms