Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SAMD8Q96LT4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SAMD8Q96LT4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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