Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUB2Q96DC9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms