Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms