Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms