Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms