Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC50Q8IVM0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC50Q8IVM0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms