Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3F3CQ6NXT2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms