Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms