Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms