Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms