Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms