Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms