Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms