Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms