Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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