Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RTN1Q16799 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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