Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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