Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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GABRA6Q16445 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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