Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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