Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC6Q16204 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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